近日，由內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)乳品生物技術(shù)與工程教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室完成的“深度混合宏基因組測(cè)序挖掘腸道微生物低豐度物種”研究成果發(fā)表于腸道微生物領(lǐng)域權(quán)威雜志《Gut Microbes》（中科院一區(qū)，腸道微生物領(lǐng)域Top期刊），題目為“Hybrid, ultra-deep metagenomic sequencing enables genomic and functional characterization of low-abundance species in the human gut microbiome”（DOI:10.1080/19490976.2021.2021790）。

 

　　該研究采用Illumina與Pacbio混合、超深度宏基因組測(cè)序的方法，首次聚焦于發(fā)掘腸道中的低豐度物種基因組的功能特征，組裝得到475個(gè)宏基因組組裝基因組（MAG），包括287個(gè)低豐度和77個(gè)極低豐度基因組。同時(shí)，該研究發(fā)現(xiàn)微生物基因組生長速率、選擇壓力及染色體可移動(dòng)遺傳元件頻率存在個(gè)體異質(zhì)性，鑒定出數(shù)千個(gè)染色體外的可移動(dòng)遺傳元件，包括5097個(gè)噬菌體和79個(gè)新的質(zhì)粒基因組，為理解腸道生態(tài)學(xué)和腸道菌群的功能特征提供了新見解。

 

　　該項(xiàng)目由國家自然科學(xué)基金國際合作重點(diǎn)項(xiàng)目（31720103911）、國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系和內(nèi)蒙古科技重大專項(xiàng)（2021ZD0014）資助。